Калифорнийская компания Profluent разрабатывает новые методы лечения пациентов с серьезными проблемами со здоровьем. В рамках проекта OpenCRISPR она выпустила первый в мире редактор генов с открытым исходным кодом, созданный искусственным интеллектом.
Компания обучила большие языковые модели на основе данных об огромном количестве белковых последовательностей. Благодаря этому нейросети смогли создать миллионы разнообразных CRISPR-подобных белков, которые не встречаются в природе.
CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats — короткие палиндромные повторы, регулярно расположенные группами) — это технология, которая с недавнего времени широко применяется для изменения ДНК.
CRISPR состоит из двух частей — белка Cas9, который может резать ДНК, и направляющей РНК, которая распознает последовательность ДНК, которую необходимо отредактировать. Сперва ученые устанавливают последовательность ДНК, которая вызывает проблемы со здоровьем. Затем они создают специальную направляющую РНК. Она добавляется к белку Cas9, после чего этот комплекс направляется в целевые клетки.
Ученые могут изменять, удалять или добавлять новые последовательности в месте разреза ДНК.
Редактор Profluent под названием OpenCRISPR-1 поддерживает прототипическую архитектуру нуклеазы Cas9 типа II, но отличается более чем на 400 мутаций от SpCas9 и почти на 200 мутаций от любого другого известного природного белка, ассоциированного с CRISPR. ИИ также создал синтетическую направляющую РНК.
Главное преимущество новой разработки — простота создания. Ранее ученым приходилось вручную создавать уникальную РНК для каждого конкретного случая. Теперь это делает ИИ.
Ранее «Мир робототехники» писал, что ученые из Вашингтонского университета разработали усовершенствованный искусственный интеллект RoseTTAFold All-Atom. Эта модель может с точностью до атома проектировать белки, ДНК, РНК и мелкие молекулы, например, железо.
