Искусственный интеллект активно изучает все аспекты жизни человека. В том числе и ее биологическую составляющую, включая ДНК.
Нейросети могут просматривать огромные массивы данных, чтобы, например, определять потенциальные риски возникновения новых генетических заболеваний. Однако ученые не уверены, как именно ИИ приходит к тем или иным выводам.
Для решения этой проблемы специалисты из лаборатории Колд-Спринг-Харбор (CSHL) разработали SQUID (Surrogate Quantitative Interpretability for Deepnets). Эта сеть, аббревиатура которой переводится на русский язык как «кальмар», должна помочь ученым интерпретировать «умозаключения» нейросетей.
Главное отличие SQUID от других инструментов анализа заключается в том, что она была специально разработана для этой работы. Сеть более последовательна, лучше снижает фоновые шумы и может лучше прогнозировать последствия генетических изменений. Это возможно благодаря использованию собранной за десятилетие базы знаний о генетике.
«Кальмар» работает так: генерирует библиотеку из более чем 100 тысяч вариантов последовательностей ДНК. Затем анализирует библиотеку мутаций и их последствия с помощью специальной программы MAVE-NN. Этот инструмент позволяет проводить тысячи виртуальных экспериментов одновременно.
Создатели SQUID уверены, что их инструмент поможет найти те нейросети, которые лучше всего справляются с анализом и прогнозированием изменений в геноме человека, сообщает The SciTechDaily.
